Quina és la trama d'Aragami? El nostre protagonista neix de les ombres després de ser invocat per una noia rossa, la Yamiko, sobre la qual anirem sabent coses a mesura que l'aventura avanci. La nostra missió serà ajudar-la a fugir dels que, sembla, la tenen tancada: els soldats de Kaiho. Ells són els soldats de la llum, els nostres antagonistes, i són increïblement perillosos per a nosaltres. Un sol atac seu i haurem fracassat.